E.U.联盟和布里塔利亚帝国旷日持久的战争在皇历2010年发生转机帝国派出压倒性的兵力突袭远东日在很短的时间内日本这个国家不复存在从此作为“11区”写入历史旧日本人民流往世界各地饱受歧视心中满是愤懑和不甘2017年E.U.联军132部队向圣彼得堡挺进但遭到帝国军队的围困面临全军覆没的危险联军少校蕾拉·玛露卡尔（坂本真绫 配音）将旧日本青年组成非正规军W Zero部队并提出以这支部队营救132部队的建议但是在最为凶险的前线他们不过肩负着牺牲自己来营救友军的悲哀命运惨烈的对决过后W Zero部队的中尉日向瑛斗（入野自由 配音）成功完成任务　　而战争还远远未曾结束新的阴谋与危机浮出水面……